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西湖大学医学院的郭天南教授及其合作者们,通过分析近 3000 份涵盖 58 种正常组织和 25 种癌症类型的人体组织样本,对超过 1.3 万种蛋白质进行了定量分析。这项工作成功构建了一幅迄今为止分辨率最高、覆盖范围最广的人体蛋白质空间分布图谱。

蛋白质作为生命活动的主要执行者,同时也是大部分药物作用的关键靶点。然而,科学界长期以来对蛋白质在人体内的整体空间分布情况缺乏系统性的了解。郭天南团队为此开发了一种微量样本蛋白质组分析新方法,使得仅需芝麻大小的组织样本即可完成标准化的蛋白质组学分析。

这项新方法不仅将分析效率提升了约十倍,还大幅降低了实验成本,为进行大规模、高通量的蛋白质组学研究奠定了技术基础。研究团队通过持续的样本收集和实验分析,最终建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库,并在此基础上对 13609 种蛋白质进行了精确的定量分析,从而绘制出这份高精度的“人体蛋白质组地图”。

基于这张蛋白质“地图”,研究团队还对 25 种癌症的肿瘤组织与癌旁组织进行了蛋白质表达差异比较,共识别出 8940 个表达存在差异的蛋白质。分析结果表明,不同癌症类型之间的蛋白质变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌组织的蛋白质变化尤为突出。

此外,研究团队还发现了 2879 个在特定癌症中才会出现表达变化的肿瘤特异蛋白。

这项研究成果已以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题发表在《自然》杂志上。目前,所有研究数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 向全球共享,研究人员可以查询蛋白质在 58 种人体组织中的表达丰度,并可对比不同癌症中蛋白质的变化情况。